大学入試センターによると、科目別平均点の中間集計結果に基づき、今回の試験で20点以上の差があったのは、理科2の生物と地学。23.66点の差がありましたが、地学の受験者が2,114人と1万人に満たなかったため、得点調整の対象から外れました。
それ以外で最も大きな差が出たのは、地理歴史で世界史Bと地理Bの7.15点、公民で政治・経済と倫理の8.12点、理科2で生物と化学の9.12点。どれも20点以上の差がつきませんでした。
2015年度のセンター試験は、理科2で得点調整があり、生物受験者に8点が追加されました。このため、一部の受験生から不公平感があるとして、不満の声が上がりました。
　
　2016年度のセンター試験は2月4日に平均点が最終発表され、4月16日以降に成績通知書の送付が予定されています。

参考：【大学入試センター】平成28年度大学入試センター試験の得点調整について（PDF）